More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0437 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  100 
 
 
221 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  67.42 
 
 
221 aa  321  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  64.98 
 
 
222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  61.29 
 
 
221 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  61.29 
 
 
218 aa  288  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.71 
 
 
225 aa  288  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  61.11 
 
 
218 aa  284  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.91 
 
 
218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.83 
 
 
219 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.83 
 
 
219 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  58.53 
 
 
218 aa  278  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.45 
 
 
219 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  58.06 
 
 
217 aa  275  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  58.99 
 
 
217 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.45 
 
 
219 aa  274  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  57.14 
 
 
223 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  46.92 
 
 
223 aa  207  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  42.25 
 
 
222 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.25 
 
 
222 aa  198  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  198  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  198  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  42.25 
 
 
222 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  45.02 
 
 
221 aa  197  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 
222 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.78 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.37 
 
 
223 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 
222 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 
222 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 
222 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 
222 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.98 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  40.11 
 
 
218 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  40.49 
 
 
221 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  37.26 
 
 
220 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.16 
 
 
224 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  35.94 
 
 
215 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
221 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 
238 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.05 
 
 
248 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.39 
 
 
227 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.3 
 
 
218 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
223 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.33 
 
 
213 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
226 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 
217 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 
219 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.45 
 
 
217 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.45 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.29 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
224 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.28 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.53 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.33 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
714 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.89 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.53 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  30 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.47 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  30 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.2 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  30 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
707 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  29.48 
 
 
233 aa  94.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  30.56 
 
 
707 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.28 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
396 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.57 
 
 
219 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  30.69 
 
 
220 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.89 
 
 
222 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.51 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 
223 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.85 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.19 
 
 
249 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
241 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
235 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 
247 aa  91.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
238 aa  91.7  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.47 
 
 
456 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>