More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02545 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  99.47 
 
 
188 aa  383  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  98.4 
 
 
188 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  98.4 
 
 
188 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  98.4 
 
 
188 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  97.87 
 
 
187 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  87.77 
 
 
269 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  87.77 
 
 
188 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  87.77 
 
 
188 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  87.23 
 
 
188 aa  343  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  87.23 
 
 
188 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  80.85 
 
 
188 aa  325  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  72.34 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  67.02 
 
 
188 aa  271  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  67.02 
 
 
188 aa  271  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  67.02 
 
 
188 aa  271  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  67.02 
 
 
188 aa  267  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  67.02 
 
 
188 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  66.49 
 
 
188 aa  259  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  65.96 
 
 
188 aa  258  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  44.68 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  44.86 
 
 
200 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.44 
 
 
201 aa  154  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  43.92 
 
 
202 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  43.92 
 
 
202 aa  151  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  43.92 
 
 
202 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.92 
 
 
200 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  41.08 
 
 
212 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  39.89 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  36.96 
 
 
204 aa  131  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  38.64 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  40.44 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.46 
 
 
197 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.76 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.1 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  38.2 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.04 
 
 
215 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.54 
 
 
208 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.16 
 
 
229 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
238 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.98 
 
 
218 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
223 aa  99  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  31.91 
 
 
215 aa  98.2  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.32 
 
 
232 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  36.26 
 
 
233 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  32.22 
 
 
396 aa  97.1  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  34.78 
 
 
986 aa  95.9  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  34.24 
 
 
219 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
236 aa  95.5  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.43 
 
 
214 aa  94.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.6 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.08 
 
 
220 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
228 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.6 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.46 
 
 
223 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  34.46 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.52 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  32.09 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.18 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.91 
 
 
207 aa  92.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.89 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
217 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 
217 aa  92.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.58 
 
 
219 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.87 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.33 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.89 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.38 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.98 
 
 
233 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.72 
 
 
227 aa  89.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 
228 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.07 
 
 
254 aa  89  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
223 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  34.5 
 
 
195 aa  88.2  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.46 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  32.42 
 
 
232 aa  88.2  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.87 
 
 
456 aa  87.8  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.73 
 
 
217 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
229 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
223 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
456 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.42 
 
 
222 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  28.88 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.22 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.69 
 
 
218 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.32 
 
 
456 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>