More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3082 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  96.88 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  70.09 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  69 
 
 		 226 aa  298  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  66.82 
 
 		 227 aa  290  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  67.41 
 
 		 228 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.96 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  59.43 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  50.88 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  35.82 
 
 		 241 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.64 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.14 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.31 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.15 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  30.33 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.38 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.95 
 
 		 456 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.36 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.95 
 
 		 456 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 456 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.22 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.98 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  29.61 
 
 		 228 aa  92  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.93 
 
 		 253 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.62 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.03 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.19 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.25 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.22 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  34.18 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  33.19 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.23 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.58 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.22 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.22 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.09 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.22 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  33.67 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.22 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.35 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.08 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  31.11 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  30.5 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.23 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  28.93 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.23 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  29.31 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  27.4 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  29.32 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.55 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  31.42 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  26.5 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  29.47 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.5 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.83 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.65 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>