More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1348 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  100 
 
 		 226 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  78.67 
 
 		 228 aa  345  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  68.14 
 
 		 225 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.31 
 
 		 224 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  69 
 
 		 224 aa  298  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60.09 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.94 
 
 		 224 aa  254  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  59.81 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  46.7 
 
 		 242 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.01 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  37.12 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  33.48 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  34.09 
 
 		 456 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.09 
 
 		 456 aa  121  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.14 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  31.39 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.49 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.27 
 
 		 456 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.86 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.78 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.76 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.63 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.09 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.86 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  30.73 
 
 		 188 aa  92  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  30.73 
 
 		 188 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  30.73 
 
 		 188 aa  92  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.69 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  29.69 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  29.69 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  29.69 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  29.69 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.8 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  30.49 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  30.73 
 
 		 187 aa  88.6  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  28.7 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.85 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.82 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.35 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.29 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.18 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  26.8 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.67 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  26.8 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  26.8 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  31.28 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  29.08 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  31.16 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.18 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.21 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.32 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  29.15 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  31.5 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.39 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0184  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  24.77 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  29.85 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  31.56 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  29.27 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  28.65 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>