More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2594 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  60.19 
 
 		 208 aa  277  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  57.97 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  61.65 
 
 		 209 aa  274  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  55.88 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  58.82 
 
 		 212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  56.8 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  32.47 
 
 		 396 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.61 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  98.2  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  25.81 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 		 232 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 221 aa  88.2  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  31.44 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 728 aa  85.5  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.5 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.57 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.52 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  29.38 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.4 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.94 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.9 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.8 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  28.21 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  30.46 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.57 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.57 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  28.49 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.47 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  28.65 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  26.4 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  27.32 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.4 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0184  HAD family hydrolase  29.14 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  25.52 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  25.39 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.87 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  26.11 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  28.04 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.99 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.96 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.13 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.18 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  28 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.72 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  26 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.42 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  26.06 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  26.06 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  26.06 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.04 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.13 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  21.2 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.08 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.51 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.05 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  27.98 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  24.75 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  30 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>