More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0708 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  90.09 
 
 		 212 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  63.5 
 
 		 212 aa  284  8e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  63.11 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  60.59 
 
 		 208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  57.28 
 
 		 209 aa  251  8.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  56.8 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  35.52 
 
 		 396 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.7 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  28.49 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.19 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.19 
 
 		 456 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.82 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 456 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  32.63 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  35.33 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  26.85 
 
 		 456 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.33 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.64 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 728 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  30.99 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.84 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.84 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.09 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  26.67 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.47 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  29.67 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  27.5 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  30.48 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.22 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.22 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.95 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  30.69 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  27.88 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.12 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.5 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.64 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  29.32 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0340  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.369886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 707 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.51 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  28.93 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 714 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  27.98 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.09 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  28 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  28.16 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  27.56 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  27.56 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  29.26 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.95 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.57 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.3 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  27.23 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.43 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.32 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.18 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  27.36 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>