More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0811 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  38.43 
 
 
221 aa  181  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.01 
 
 
225 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.26 
 
 
218 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.79 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
229 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  37.61 
 
 
234 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.86 
 
 
233 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.97 
 
 
231 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  40.38 
 
 
233 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.67 
 
 
254 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.5 
 
 
233 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
232 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 
218 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.8 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.07 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  32 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  37.25 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.25 
 
 
223 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  38.83 
 
 
232 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  39.05 
 
 
221 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
218 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.56 
 
 
456 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  34.47 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.95 
 
 
456 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.65 
 
 
456 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.02 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
225 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.08 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.97 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  31.22 
 
 
228 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.49 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.87 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.86 
 
 
217 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
223 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.67 
 
 
219 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  35.98 
 
 
219 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
216 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  33.17 
 
 
221 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
396 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  34.26 
 
 
237 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.68 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  31.63 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.28 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.09 
 
 
215 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  31.91 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.24 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  34.72 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  32.24 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  29.19 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.23 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  30.77 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  34.08 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.5 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.73 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  33.87 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  34.16 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  32.85 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  31.35 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.8 
 
 
1053 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.22 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.69 
 
 
1314 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.66 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
219 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
235 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  29 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  31.55 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.03 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 
238 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.05 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.16 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  27.83 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  31.67 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  30.05 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  24.32 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.15 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  28.81 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  27.19 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  30.26 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
242 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.44 
 
 
225 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  30.26 
 
 
219 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>