More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1994 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  100 
 
 
202 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  99.5 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  98.51 
 
 
202 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  87.94 
 
 
201 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  86.43 
 
 
200 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  63.78 
 
 
200 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  45.26 
 
 
188 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  44.39 
 
 
188 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  44.39 
 
 
188 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  44.39 
 
 
188 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  44.44 
 
 
188 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  44.44 
 
 
188 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  44.44 
 
 
188 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  44.44 
 
 
188 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  43.92 
 
 
188 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  43.92 
 
 
188 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  43.92 
 
 
188 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  43.92 
 
 
188 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  44.44 
 
 
188 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  43.92 
 
 
188 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  43.39 
 
 
188 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  44.44 
 
 
187 aa  148  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  42.86 
 
 
269 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  42.86 
 
 
188 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  42.86 
 
 
188 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.39 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  42.33 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  42.33 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  43.39 
 
 
188 aa  141  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.75 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  39.78 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.89 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  36.26 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  34.74 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  35.11 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  36.17 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.87 
 
 
218 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.5 
 
 
202 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  36.22 
 
 
234 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.98 
 
 
986 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.5 
 
 
208 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.11 
 
 
215 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  34.25 
 
 
204 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.35 
 
 
216 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.91 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  36.81 
 
 
185 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.5 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  29.5 
 
 
219 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  31.38 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.94 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  37.3 
 
 
233 aa  94.7  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.41 
 
 
233 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.17 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  30.89 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
219 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  32.62 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  32.45 
 
 
965 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  30.69 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.91 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.17 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
209 aa  89  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.75 
 
 
254 aa  88.6  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  34.74 
 
 
224 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  29.57 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
235 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
271 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
396 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.83 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  32 
 
 
208 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  30.1 
 
 
585 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  32.43 
 
 
221 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
236 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.95 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.21 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  30.3 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.32 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  30.3 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  28.26 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
223 aa  85.1  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  28.42 
 
 
216 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  34.64 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.3 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>