More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6064 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.73 
 
 
193 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.44 
 
 
218 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.71 
 
 
208 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.76 
 
 
202 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.44 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
202 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
202 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  36.04 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
202 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 
188 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.42 
 
 
201 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 
188 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 
188 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
238 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 
188 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 
200 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  35.87 
 
 
188 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.53 
 
 
188 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  34.57 
 
 
200 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  36.04 
 
 
187 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.84 
 
 
188 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  35.87 
 
 
269 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  35.87 
 
 
188 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  35.87 
 
 
188 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 
188 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  37.71 
 
 
242 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  34.01 
 
 
188 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  35.33 
 
 
188 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  31.18 
 
 
200 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.28 
 
 
188 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  34.41 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  29.63 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.72 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  31.49 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  33.53 
 
 
185 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  32.14 
 
 
194 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  35.68 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
396 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  35.68 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.83 
 
 
218 aa  91.3  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.96 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.6 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  36.6 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4814  HAD family hydrolase  36.42 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.79 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  33.33 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.02 
 
 
456 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.04 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.53 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.24 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  34.59 
 
 
224 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
252 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.61 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.95 
 
 
456 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.29 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  32.98 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.99 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  35.48 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  36.68 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  34.24 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  35 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.79 
 
 
232 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  35.2 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  32.16 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.86 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.11 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.69 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  35.56 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>