More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2101 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  100 
 
 
231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  49.77 
 
 
225 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  55.09 
 
 
216 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  46.98 
 
 
228 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.99 
 
 
213 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  46.05 
 
 
220 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.83 
 
 
217 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  43.19 
 
 
228 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  49.09 
 
 
219 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  45.58 
 
 
227 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  45.24 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  45.33 
 
 
241 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  42.18 
 
 
230 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  39.62 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.95 
 
 
221 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.55 
 
 
223 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  39.15 
 
 
221 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  38.39 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.02 
 
 
220 aa  121  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  50.38 
 
 
142 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  39.33 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.7 
 
 
231 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  40.55 
 
 
247 aa  113  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.58 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.37 
 
 
215 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.68 
 
 
218 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.78 
 
 
219 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.5 
 
 
223 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.84 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
225 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
226 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
221 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  32.59 
 
 
228 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.55 
 
 
258 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  36.44 
 
 
256 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.07 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.24 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.52 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  38.39 
 
 
248 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.17 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  30.98 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  30.98 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.43 
 
 
456 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  34.21 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 
203 aa  92  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.46 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.02 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.14 
 
 
233 aa  91.7  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.65 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  30 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.45 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  30.6 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.62 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.05 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.59 
 
 
456 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.43 
 
 
456 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  33.68 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.04 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.88 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
216 aa  89.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.95 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.11 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.81 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  27.78 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
241 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  35.33 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  28.7 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.41 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
262 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>