More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01370 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  50.68 
 
 
237 aa  204  8e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  41.32 
 
 
411 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  36.89 
 
 
224 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  36.65 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  35.75 
 
 
224 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  35.62 
 
 
218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  35.62 
 
 
218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  35.62 
 
 
218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
227 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
227 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  34.93 
 
 
227 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  34.23 
 
 
218 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  36.46 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  36.63 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.2 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  35.53 
 
 
216 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.41 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  35.94 
 
 
219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
222 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
224 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 
209 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.42 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.03 
 
 
224 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.97 
 
 
216 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  38.46 
 
 
219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  38.46 
 
 
219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  38.46 
 
 
219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  38.46 
 
 
219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  38.97 
 
 
216 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  38.46 
 
 
219 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  33.78 
 
 
236 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.36 
 
 
222 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  38.54 
 
 
234 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  33.04 
 
 
253 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  34.27 
 
 
221 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.04 
 
 
215 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.82 
 
 
223 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.29 
 
 
214 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.85 
 
 
226 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  28.95 
 
 
214 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.1 
 
 
379 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 
212 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.13 
 
 
224 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
237 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.55 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.49 
 
 
213 aa  85.5  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.31 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.44 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
735 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.52 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.48 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
235 aa  82  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  30.3 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  27.93 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  29.32 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.57 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.24 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.63 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.05 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.22 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  31.08 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25.81 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.88 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  27.5 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.89 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.89 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  27.43 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.12 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.59 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>