More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3992 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.71 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  36.57 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  38.89 
 
 
233 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.86 
 
 
232 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.39 
 
 
254 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.57 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.05 
 
 
232 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 
225 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.41 
 
 
225 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.86 
 
 
219 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.7 
 
 
218 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 
231 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
232 aa  121  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.45 
 
 
219 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.5 
 
 
456 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 
220 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  37.04 
 
 
219 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  32.06 
 
 
222 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29 
 
 
456 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
226 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
456 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  33.86 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  33.51 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.26 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  30.15 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  30.53 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  31.22 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.31 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.58 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  32.98 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.27 
 
 
216 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  31.52 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
978 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  31.43 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  31.38 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  31.52 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  31.84 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  31.52 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  31.52 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.69 
 
 
188 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.69 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.69 
 
 
188 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.69 
 
 
188 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.69 
 
 
188 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  32.79 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.8 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  27.75 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.23 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  31.25 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  30.53 
 
 
188 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  26.51 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  32.29 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  28.79 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  27.36 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  31.53 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  29.59 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  30.6 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  30.6 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  30.6 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  31.47 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  27.75 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  29.1 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  30.65 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  29.44 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  27.75 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.35 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.93 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.3 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  28.34 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.35 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  29.67 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  28.77 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  27.13 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>