More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2483 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  65.95 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  67.58 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  62.17 
 
 		 234 aa  295  5e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.72 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  65.18 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.27 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.57 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.27 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.47 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.08 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.53 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.62 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  32.62 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.11 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.11 
 
 		 456 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 456 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.54 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  33.17 
 
 		 188 aa  95.1  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  31.08 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  31.5 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  31.49 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.41 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  34.81 
 
 		 188 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.18 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  34.81 
 
 		 188 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  34.81 
 
 		 188 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  33.86 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  35.26 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.26 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  34.05 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.98 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  36.87 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  32.46 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  34.74 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.11 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  32.99 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.24 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  31.12 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  34 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.98 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  29.53 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.98 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  34.74 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.98 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.98 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  32.99 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  32.64 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  32.64 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  34.2 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  37.43 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.59 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.25 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.98 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  32.07 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  34.21 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  26.27 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.54 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  32.64 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.65 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  34.33 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  34.21 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.19 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  34.21 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.19 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  32.12 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  32.11 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.06 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.89 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>