More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1395 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
238 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  38.29 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  34.62 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.9 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  32.4 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  34.43 
 
 
200 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  104  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.56 
 
 
232 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  31.91 
 
 
188 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  31.28 
 
 
188 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  31.28 
 
 
188 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.2 
 
 
233 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 
218 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  29.38 
 
 
188 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.97 
 
 
232 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  33.51 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.52 
 
 
197 aa  98.2  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.75 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.85 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.15 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  30.85 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  30.85 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  30.85 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  30.85 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.24 
 
 
234 aa  95.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
202 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
187 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
269 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.16 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  29.79 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.15 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.39 
 
 
201 aa  91.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  29.26 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  31.11 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  30.05 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  34.27 
 
 
176 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  29.26 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.79 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.07 
 
 
233 aa  89  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
236 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  30.16 
 
 
200 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.72 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  30.3 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.48 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.84 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.9 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.18 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  31.91 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.57 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.89 
 
 
379 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  31.89 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.73 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  35.08 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.29 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.57 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  32.57 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.21 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.57 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.69 
 
 
456 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.15 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.28 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  31.07 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.21 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  27.81 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  28.98 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  25.13 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  27.17 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  25.84 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.01 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  28.14 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  26.98 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  29.71 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
232 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  30.29 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.69 
 
 
456 aa  71.6  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  27.69 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>