More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00226 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  100 
 
 
194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.6 
 
 
197 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  48.7 
 
 
200 aa  194  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  42.27 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  45.86 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  42.46 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  42.46 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  42.46 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  40.98 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  41.34 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  41.11 
 
 
188 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.4 
 
 
201 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  40.22 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.46 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  39.78 
 
 
202 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  39.78 
 
 
202 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  39.78 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  36.41 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  37.43 
 
 
238 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.46 
 
 
202 aa  121  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  40.56 
 
 
188 aa  121  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.78 
 
 
200 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  40 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.2 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  38.2 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  38.2 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  38.2 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  37.64 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  37.64 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  37.64 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  38.2 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  37.78 
 
 
269 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  37.78 
 
 
188 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  37.78 
 
 
188 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  37.22 
 
 
188 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  34.83 
 
 
204 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  37.22 
 
 
188 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  37.64 
 
 
187 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.08 
 
 
218 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.57 
 
 
193 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  32.4 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.24 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  32.4 
 
 
225 aa  94.7  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
235 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.67 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.02 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.64 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
236 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.72 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  31.89 
 
 
271 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.15 
 
 
233 aa  88.2  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
222 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
213 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 
227 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.17 
 
 
456 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 
208 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  31.02 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  30.69 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
217 aa  85.1  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
256 aa  85.1  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  30.11 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.29 
 
 
456 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
233 aa  85.1  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.42 
 
 
217 aa  84.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.25 
 
 
227 aa  84  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
456 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.61 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
232 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.66 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  34.59 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.02 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  29.19 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.72 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  31.14 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.34 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  26.88 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.53 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  27.6 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.8 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  29.1 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.88 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  27.41 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.6 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  31.63 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  27.23 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
216 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>