More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3792 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  64.41 
 
 		 232 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  39.53 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.67 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.6 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.94 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.94 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.4 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.27 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.9 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.57 
 
 		 254 aa  128  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.6 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  38.94 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  29.77 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.1 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.15 
 
 		 456 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.15 
 
 		 456 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  29.49 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.16 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  37.7 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  37.7 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  37.7 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  37.16 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  37.16 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  37.16 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  37.16 
 
 		 188 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 456 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.32 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.29 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  33.69 
 
 		 188 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  37.7 
 
 		 187 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.45 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  32.45 
 
 		 188 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 269 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.55 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  33.69 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  33.16 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  33.88 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  33.88 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  33.88 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.28 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  31.25 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  32.62 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  29.95 
 
 		 188 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  32.24 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  31 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  26.03 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.34 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  35.26 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.25 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.02 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.5 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  32.13 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  29.47 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.86 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.12 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  34.03 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  34.03 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.47 
 
 		 202 aa  85.1  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.5 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.09 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  27.75 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  31.41 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.12 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>