More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0332 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  76.5 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.83 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.46 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.52 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.98 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.32 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.63 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.77 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.2 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.18 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.02 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.06 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.04 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.18 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  34.63 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.2 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.39 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.59 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  33.64 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.36 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 456 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.3 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  31.71 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.68 
 
 		 456 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.18 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  29.05 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.8 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  30.29 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.35 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.08 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.11 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.5 
 
 		 456 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.12 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.51 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.57 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  32.07 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  37.5 
 
 		 187 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  37.97 
 
 		 188 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  28.72 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  35.78 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  31.41 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.05 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.77 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.36 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  37.43 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  37.43 
 
 		 188 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.52 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  37.04 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.21 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  34.57 
 
 		 188 aa  92  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.24 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.53 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.24 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.53 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>