More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1478 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
220 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  56.84 
 
 
222 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.41 
 
 
224 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.48 
 
 
379 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.95 
 
 
215 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
222 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  44.85 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  43.54 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  43.54 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.83 
 
 
223 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  42.65 
 
 
218 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.09 
 
 
222 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  42 
 
 
224 aa  148  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.45 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  43.64 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.55 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  45.21 
 
 
224 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.2 
 
 
215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  44.81 
 
 
216 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  44.94 
 
 
219 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  50.27 
 
 
221 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  43.28 
 
 
218 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  43.28 
 
 
218 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  43.28 
 
 
218 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  42.7 
 
 
218 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  48.15 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  36.67 
 
 
224 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  38.03 
 
 
224 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.6 
 
 
214 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  39.44 
 
 
218 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  43.33 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  43.33 
 
 
216 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  44.88 
 
 
735 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  43 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  43.33 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  43 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  43 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  43 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  42.86 
 
 
216 aa  128  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  44.2 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  44.2 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  44.2 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  44.2 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  44.2 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.52 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  41.29 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  41.79 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.62 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  35.68 
 
 
236 aa  108  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  30.54 
 
 
214 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  46.5 
 
 
234 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  34.93 
 
 
411 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  33.17 
 
 
456 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
456 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  33.17 
 
 
456 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.17 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  38.62 
 
 
325 aa  86.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  38.36 
 
 
237 aa  85.9  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  36.19 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  38.36 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  33.86 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  40.54 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.97 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.14 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.22 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  38.67 
 
 
271 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  34.74 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3229  putative hydrolase  40.61 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0208525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  36.79 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  37.7 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.65 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  39.73 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.15 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
269 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.78 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.66 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.87 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.02 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.87 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.65 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.44 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>