More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1449 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  90.54 
 
 
223 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  57.21 
 
 
222 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  57.94 
 
 
227 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  57.94 
 
 
227 aa  252  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  57.97 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  57.01 
 
 
227 aa  244  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.08 
 
 
222 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  57.07 
 
 
216 aa  231  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.06 
 
 
222 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  60.98 
 
 
221 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  55.05 
 
 
224 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  43.84 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  44.2 
 
 
224 aa  151  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.45 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.39 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.63 
 
 
215 aa  138  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  38.6 
 
 
219 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42 
 
 
215 aa  134  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  40.49 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  40.49 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  38.6 
 
 
218 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  40.8 
 
 
218 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.79 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  36.74 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.84 
 
 
212 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.58 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  35.68 
 
 
224 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  43.58 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.58 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  43.58 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  43.58 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  43.02 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  43.02 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  43.58 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  43.02 
 
 
216 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  43.02 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  32.02 
 
 
214 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  39.01 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.7 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  43.87 
 
 
234 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  39.89 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  39.89 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  39.89 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  39.89 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  39.89 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  41.14 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.3 
 
 
224 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.78 
 
 
735 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.07 
 
 
379 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.47 
 
 
242 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  38.75 
 
 
231 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  33.85 
 
 
250 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  33.98 
 
 
411 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  33.52 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.71 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  35.79 
 
 
237 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  33.51 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.11 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.91 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  33.03 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  34.1 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  31.47 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  33.12 
 
 
325 aa  71.6  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.51 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.24 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  34.43 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  34.43 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  34.43 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.62 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.47 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.25 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  33.19 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.28 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.25 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.25 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.25 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  33.19 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  33.19 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.19 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  33.19 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  25.55 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  31.64 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  26.32 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.15 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  26.83 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  26.83 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  26.83 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  32.6 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.18 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  29.65 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>