More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1634 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 221 aa  456  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  39.47 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  35.92 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  35.58 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  37.02 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  35.61 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  35.29 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  34.13 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.3 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.41 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  34.8 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  32.06 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.45 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.48 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.14 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.48 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  35.48 
 
 		 762 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  35.47 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  35.98 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  34.56 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 707 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.75 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 710 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  30.29 
 
 		 707 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 714 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2477  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2343  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  34.22 
 
 		 267 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.51 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  34.57 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.43 
 
 		 235 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  32.41 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.65 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 728 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.14 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  36.16 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  28.27 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  34.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.53 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.28 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.62 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  32.62 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.88 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  29.63 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.29 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  31.55 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1197  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.17 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  0.148864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  32.45 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  31.32 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  27.37 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  32.09 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.69 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.82 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.41 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>