More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2343 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2343  HAD family hydrolase  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2477  HAD family hydrolase  99.56 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  87.95 
 
 		 226 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  91.19 
 
 		 227 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  89.87 
 
 		 230 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  89.87 
 
 		 230 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  90.31 
 
 		 230 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  81.11 
 
 		 762 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  81.11 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  81.11 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  81.11 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  81.11 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  81.11 
 
 		 224 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  80.18 
 
 		 224 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  81.48 
 
 		 224 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.8 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  39.81 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  36.97 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  35.41 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.14 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.37 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  35.32 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.02 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.69 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  34.1 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 728 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  40.48 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.95 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.44 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.5 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 714 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  33.95 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 		 707 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 707 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 710 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.57 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.87 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.7 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 271 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.1 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.1 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.97 
 
 		 273 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.17 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  35.47 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.21 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  37.21 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  30.57 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  30.57 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1217  HAD family sugar phosphatase  30.89 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.63 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.88 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.32 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.84 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.1 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.05 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  30.16 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.05 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  31.25 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1268  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2349  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.56 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  35.52 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.22 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.3 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  32.62 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  35.61 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.75 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  32.29 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.52 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  37 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.51 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>