More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4044 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  56.56 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  56.56 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  56.56 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  56.56 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  56.56 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  56.11 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  56.56 
 
 		 762 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  50 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  55.66 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  52.73 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  52.73 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  52.27 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  51.57 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2477  HAD family hydrolase  51.35 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2343  HAD family hydrolase  52.25 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  36.06 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  34.68 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  37.96 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 		 217 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.18 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.79 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  38.39 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  36.46 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.86 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  36.53 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.02 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 728 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.55 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  34.03 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.85 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  35.11 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  34.03 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.04 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.92 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  38.22 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.89 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  33.17 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.07 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.64 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.69 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  34.35 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.7 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  40.25 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.25 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  32.62 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.86 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  33.18 
 
 		 707 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 710 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  32.73 
 
 		 707 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.59 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  31.19 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  37.74 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  33.96 
 
 		 271 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1217  HAD family sugar phosphatase  31 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.21 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.15 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  31.05 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  36.36 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 714 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.82 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.49 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.43 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4889  HAD family hydrolase  37.62 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351284  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.8 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  33.01 
 
 		 456 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  38.34 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  34.01 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.63 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.05 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.54 
 
 		 456 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  28.7 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>