More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2777 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  93.3 
 
 		 224 aa  420  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  77.67 
 
 		 218 aa  337  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  72.22 
 
 		 218 aa  320  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  69.91 
 
 		 218 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  69.91 
 
 		 218 aa  311  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  69.91 
 
 		 218 aa  311  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  73.85 
 
 		 218 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  70.62 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  70.62 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.62 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  70.62 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  70.62 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  70.62 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  70.62 
 
 		 216 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  70.62 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  69.19 
 
 		 216 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  63.98 
 
 		 219 aa  280  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  66.51 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  66.51 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  66.51 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  66.51 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  66.51 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.42 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.05 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  42.61 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.32 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  38.35 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.53 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  38.24 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  40.22 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.03 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  38.24 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  36.65 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.61 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40.37 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.15 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.11 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.76 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.93 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 		 735 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  40 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.15 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  36.89 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  36.36 
 
 		 411 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.32 
 
 		 379 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  29.3 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.23 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  32.71 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  35.82 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  36.54 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  34.67 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 456 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.67 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.21 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  32.31 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.55 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.22 
 
 		 456 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.22 
 
 		 456 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.51 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.68 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.86 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  33.77 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.38 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.57 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  32.58 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.69 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  32.55 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.6 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  32.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  32.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.86 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.67 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  32.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  32.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.03 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.86 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  29.41 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  34.29 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  32.86 
 
 		 762 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3229  putative hydrolase  32.35 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0208525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>