More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1208 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  94.14 
 
 
222 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  59.52 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  59.52 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  59.33 
 
 
227 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  56.81 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  54.17 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55.56 
 
 
223 aa  227  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.06 
 
 
226 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  56.85 
 
 
216 aa  221  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  53.59 
 
 
221 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  51.79 
 
 
224 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  38.79 
 
 
218 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  39.34 
 
 
219 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  43.72 
 
 
218 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  46.74 
 
 
218 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  46.74 
 
 
218 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.48 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  46.74 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.55 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  41.05 
 
 
224 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  45.79 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.79 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  45.79 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  40.53 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  45.79 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  45.79 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  45.26 
 
 
216 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  45.26 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  45.26 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  46.07 
 
 
735 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  45.26 
 
 
216 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.84 
 
 
224 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  41.53 
 
 
218 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
224 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.26 
 
 
214 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  41.18 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.58 
 
 
212 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.74 
 
 
379 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  48.39 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  40.21 
 
 
219 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  40.21 
 
 
219 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  40.21 
 
 
219 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  40.21 
 
 
219 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  40.21 
 
 
219 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.66 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  41.61 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  41.11 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.11 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  35.41 
 
 
411 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.68 
 
 
242 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  28.33 
 
 
214 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  32.8 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  40.96 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.81 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  35.42 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.52 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  33.33 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.8 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.5 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.43 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.71 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  33.71 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  36.26 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.21 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.12 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
286 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  28.5 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.32 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  29.29 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  32.73 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.77 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.72 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  31.84 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  32.62 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  28.35 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  28.8 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  32.28 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  32.67 
 
 
762 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>