More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4343 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  100 
 
 
231 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  77.36 
 
 
215 aa  307  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.04 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  43.89 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  41.5 
 
 
236 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  39 
 
 
218 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  40.4 
 
 
224 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.17 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.62 
 
 
222 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.79 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  44.51 
 
 
216 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  39.22 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  39.22 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  40.1 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  40.1 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  40.1 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  36.82 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  45.6 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.03 
 
 
379 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  41.11 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  39.22 
 
 
227 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.9 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  35.82 
 
 
224 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  34.18 
 
 
214 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  35.32 
 
 
224 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  39.3 
 
 
216 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  39.3 
 
 
216 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  39.3 
 
 
216 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  39.3 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  38.81 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.81 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  38.81 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  38.81 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  36.82 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  38.81 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.11 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.23 
 
 
223 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.57 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  39.41 
 
 
219 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  39.41 
 
 
219 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  39.41 
 
 
219 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  39.41 
 
 
219 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  39.41 
 
 
219 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.72 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  38.35 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.09 
 
 
735 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  39.32 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.9 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  35.78 
 
 
411 aa  112  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.78 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  42.44 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.47 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.59 
 
 
242 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.9 
 
 
224 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42440  DL-glycerol-3-phosphatase  36.84 
 
 
253 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  33.18 
 
 
250 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  41.57 
 
 
221 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  42.95 
 
 
234 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  34.88 
 
 
237 aa  102  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.37 
 
 
225 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.24 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  32.38 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  36.57 
 
 
168 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  27.18 
 
 
456 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.21 
 
 
456 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.5 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  25.85 
 
 
456 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.3 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.84 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.95 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  33.56 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  22.94 
 
 
214 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.54 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.99 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.9 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.51 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  28.38 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  36.78 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.25 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3229  putative hydrolase  36.2 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0208525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  36.82 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.51 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.18 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.8 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.24 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  29.82 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  33.03 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  33.82 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.78 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>