More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  100 
 
 
242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.64 
 
 
220 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  41.51 
 
 
224 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  44.04 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  40.18 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.11 
 
 
379 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  41.36 
 
 
218 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  40.18 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  40.37 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  40.65 
 
 
218 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  40.65 
 
 
218 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  40.65 
 
 
218 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  39.64 
 
 
218 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.03 
 
 
209 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  39.72 
 
 
218 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 
735 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.78 
 
 
224 aa  118  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  34.2 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.81 
 
 
215 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.45 
 
 
224 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.42 
 
 
215 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  37.73 
 
 
222 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  41.67 
 
 
216 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  41.67 
 
 
216 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  41.15 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  41.15 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.15 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  41.15 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  41.15 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  39.5 
 
 
411 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  41.15 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  38.22 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  39.11 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  39.11 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  39.11 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  39.11 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  39.11 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.47 
 
 
226 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.68 
 
 
222 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.26 
 
 
223 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
216 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
224 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 
222 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  34.87 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  36.07 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  38.05 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.46 
 
 
212 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  35.83 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  35.83 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  37.2 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  36.19 
 
 
236 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.6 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  37.85 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01280  glycerol-1-phosphatase, putative  32.89 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  31.38 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.57 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  31.98 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.28 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  32.52 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.42 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.49 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.88 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29 
 
 
456 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  34.51 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  36.6 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  34.02 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.32 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.41 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  23.58 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.59 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  31.34 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.49 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.95 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  31.38 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  28.49 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.93 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  28.49 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  28.49 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.82 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  27.27 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  32.97 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>