More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0349 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
250 aa  518  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  35.42 
 
 
213 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  34.93 
 
 
214 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  30.73 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.53 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
223 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.98 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.49 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  28.99 
 
 
221 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.18 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.32 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.46 
 
 
456 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  32.98 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  30.26 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  32.62 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  32.62 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  32.62 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.62 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  32.62 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  31.91 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  31.91 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.95 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  31.91 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  32.62 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.51 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  32.62 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.5 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  31.91 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.12 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  32.09 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  30 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  32.09 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  33.51 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  33.51 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  33.51 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  33.51 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  33.51 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25.26 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 
220 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  31.38 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  34.52 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  29.36 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  26.47 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.34 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  28.92 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.69 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.74 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  31.03 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  31.75 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.43 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.95 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.78 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.15 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  32.98 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.19 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  24.51 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  30.48 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.63 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.7 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.16 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  30 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.43 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  27.75 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  31.66 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  32.42 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.89 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.13 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.05 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.85 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>