More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2488 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  49.03 
 
 		 212 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  36.14 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.52 
 
 		 456 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 456 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.27 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  37.09 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.93 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.47 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.19 
 
 		 456 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  33.66 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  36.45 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  36.45 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.26 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  36.45 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  31.79 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  34.63 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.56 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  33.68 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  34.31 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  34.31 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  35.36 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  34.31 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  34.31 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  34.31 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  34.8 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  34.8 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  34.31 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.18 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.58 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  39.32 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 250 aa  92  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.99 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  35.27 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.76 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.97 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.1 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.98 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  35.86 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  35.86 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.67 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  33.33 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  33.51 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.82 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.86 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  32.96 
 
 		 168 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  34.59 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.15 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.81 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  32.07 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.17 
 
 		 379 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.65 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.08 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.92 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.57 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.9 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  33.17 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  33.17 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  33.17 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.39 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.83 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  33.17 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  33.17 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  30.94 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.67 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>