More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4360 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  96.86 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  93.27 
 
 		 223 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  72.6 
 
 		 221 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  66.06 
 
 		 227 aa  294  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  55.66 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  54.59 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  57.34 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.7 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.61 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.49 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.88 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.5 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.65 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  33.97 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.37 
 
 		 456 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.22 
 
 		 327 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.09 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  31.22 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.32 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  30 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  30.26 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1427  HAD family hydrolase  33.86 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.828576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.98 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.37 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.85 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  28.1 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.3 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.89 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.6 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.84 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.44 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  27.98 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.58 
 
 		 296 aa  74.7  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.79 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  27.83 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  27.83 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.63 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.1 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.22 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  29.02 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  34.52 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>