More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0228 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  69.44 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  69.72 
 
 		 223 aa  305  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  50 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.3 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.51 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  41.43 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  40.95 
 
 		 234 aa  148  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  40.83 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  37.05 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  38.74 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.29 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  38.25 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.35 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.21 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  36.62 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.89 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  39.36 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.49 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.13 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.43 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.96 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  37.96 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.49 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  30.91 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.52 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.52 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.25 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.12 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  28.42 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  26.16 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  24.86 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  28.99 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.31 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.53 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.22 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.73 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  28.66 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.62 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.45 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  25.65 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.58 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  35.11 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  26.96 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.37 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.41 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  26.73 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.82 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  26.84 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  24.86 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  31.84 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.7 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.24 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0705  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.8 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1319  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  24.86 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>