More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3439 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.13 
 
 		 234 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.7 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  45.41 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  45.16 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  41.36 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.92 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.79 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  43.83 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.9 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.05 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  41.35 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.28 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.97 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  36.49 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  37.85 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.93 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  36.62 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  35.98 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  34.25 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.62 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  36.87 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.58 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  33.81 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.02 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.7 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.09 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  29.49 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.33 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.46 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.96 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.06 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.26 
 
 		 296 aa  72  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.77 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.51 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  25.68 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  25.43 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.53 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  26.64 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  24.48 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.65 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  24.22 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.86 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  27.44 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  29.39 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.67 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  24.47 
 
 		 456 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  25.76 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  25.45 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  23.71 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.46 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.99 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  28.93 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  23.65 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  25.53 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>