More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4680 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  69.72 
 
 		 220 aa  305  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  68.52 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.36 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.74 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.49 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  39.27 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.92 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  35 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.17 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.35 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.88 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  33.96 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  32.86 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  39.81 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.15 
 
 		 327 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.03 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  32.08 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.39 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.92 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  32.39 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  29.02 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  29.02 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  28.9 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  29.02 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  29.02 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.44 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.98 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.56 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.29 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.5 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  29.02 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  29.44 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.98 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.31 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  29.38 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  25.87 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  26.32 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  27.46 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.64 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  28.17 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  26.48 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.94 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  25.57 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.49 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  24.62 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.97 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  27.46 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  22.35 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.41 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  27.37 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.47 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  25.59 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.93 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.81 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>