More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2426 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  98.66 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  97.32 
 
 		 224 aa  407  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  79.02 
 
 		 224 aa  353  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  79.37 
 
 		 224 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  76.79 
 
 		 224 aa  348  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  79.37 
 
 		 224 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  77.58 
 
 		 224 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  79.37 
 
 		 224 aa  347  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  78.03 
 
 		 224 aa  345  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  78.92 
 
 		 224 aa  344  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  78.92 
 
 		 224 aa  344  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  78.48 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  78.48 
 
 		 224 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  75 
 
 		 224 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  76.02 
 
 		 225 aa  333  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  75.78 
 
 		 224 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  71.49 
 
 		 232 aa  315  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  67.42 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  61.43 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  61.43 
 
 		 224 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  63.59 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  38.99 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  40.09 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  42.47 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  36.92 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  36.92 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  36.92 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.62 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.96 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.07 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.15 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.94 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.48 
 
 		 260 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.23 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  32.27 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  27.6 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.54 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.09 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  35.68 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  35.14 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  29.56 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.67 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.78 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  36.22 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  35.84 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.09 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.79 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  35.76 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.13 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.1 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.26 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.78 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  29.48 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  28.87 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  26.89 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.73 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  33.33 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.51 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.41 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.6 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.8 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  32.8 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.79 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  26.83 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.76 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  32.29 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  34.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  34.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  34.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>