More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4249 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  75.89 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  74.66 
 
 		 225 aa  334  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  74.89 
 
 		 224 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  74.89 
 
 		 224 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  73.99 
 
 		 224 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  74.44 
 
 		 224 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  74.44 
 
 		 224 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  74.89 
 
 		 224 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  72.77 
 
 		 224 aa  331  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  73.99 
 
 		 224 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  73.99 
 
 		 224 aa  328  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  72.65 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75.89 
 
 		 224 aa  321  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  70.85 
 
 		 224 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  74.55 
 
 		 224 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75 
 
 		 224 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  71.1 
 
 		 232 aa  307  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  64.98 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  58.74 
 
 		 327 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  57.85 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  60.27 
 
 		 228 aa  257  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  40.37 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  40.69 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.68 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.49 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.36 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.52 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.18 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  28.9 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  28.85 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.95 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.99 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.06 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  25.58 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.32 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.34 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.95 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  36.96 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  28.37 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  31.78 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.8 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.8 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  35.14 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  35.14 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  28.21 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.24 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  35.14 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.81 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  34.05 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.37 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.93 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  29.73 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.32 
 
 		 735 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  30.22 
 
 		 762 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.15 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  34.39 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.65 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.88 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.43 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>