More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1880 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.1 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.23 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.06 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.12 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  43.83 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.72 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  41.23 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  40.09 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.39 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  38.26 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  36.15 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  35.65 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.67 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.1 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.78 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.19 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.04 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.75 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  25.69 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.11 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  25.69 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  27.36 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.64 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.24 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.24 
 
 		 456 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  28.19 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  26.86 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  28.83 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  29.13 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  25.46 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  22.52 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.07 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.07 
 
 		 456 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.99 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  31.58 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  22.39 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.03 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  26.79 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  25.7 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  28.83 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>