More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0740 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  64.15 
 
 
216 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  53.08 
 
 
214 aa  226  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  54.33 
 
 
217 aa  222  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  53.66 
 
 
216 aa  218  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  52.86 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  52.38 
 
 
213 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  52.38 
 
 
213 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.89 
 
 
212 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  42.72 
 
 
212 aa  166  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  32.82 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.18 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.64 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  34.52 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
225 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
252 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.99 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  30.32 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
252 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
234 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.78 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
232 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  33.16 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.93 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  33.69 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  34.66 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.38 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.55 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.37 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  28.27 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.92 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  29.41 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.28 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  29.59 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  28.65 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.41 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.79 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.2 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  30.89 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  27.46 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.54 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>