More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1056 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  64.73 
 
 
207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  49.76 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  49.75 
 
 
205 aa  198  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0774  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  50.28 
 
 
208 aa  179  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  45.05 
 
 
206 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  44.51 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  43.96 
 
 
206 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  37.85 
 
 
209 aa  111  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.85 
 
 
212 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 
250 aa  81.3  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  30.27 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 
461 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  27.69 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  28.21 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  24.04 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.4 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.08 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  29.27 
 
 
234 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  25.59 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.35 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 
232 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.76 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  26.11 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  27.96 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  25.38 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  27.6 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  25.47 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  26.84 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.35 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.59 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  26.74 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  26.88 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.02 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.46 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.22 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  23.85 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  23.08 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.79 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.19 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.68 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  24.54 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  26.29 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>