More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0893 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  49.76 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.89 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  42.23 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0774  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  42.35 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  39.01 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  39.56 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  38.46 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  34.74 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 250 aa  94.7  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.56 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  24.63 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.79 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  26.37 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  24.26 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  26 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  23.9 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.11 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  24.38 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  25.98 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.02 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  23.53 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  23.5 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.22 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  25 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.6 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  24.27 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  25.79 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  31.5 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  23.87 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.32 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  23.41 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  28.04 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  25.63 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  27.42 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  30 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>