More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0774 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0774  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  65.98 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  66.49 
 
 		 206 aa  264  7e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  65.46 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  50.28 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.7 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.41 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  42.35 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.24 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  34.24 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.82 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.22 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  31.79 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  32.12 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.09 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 		 272 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  24.19 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.14 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  25.5 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  28.82 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.04 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  26.09 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  25.95 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  23.56 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  24.59 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  26.88 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  26.11 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  25.62 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  28.34 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  25.27 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  23.94 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  26.49 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  23.76 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1246  HAD superfamily hydrolase  27.47 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  25.46 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  26.97 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  23.76 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  27.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  23.76 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  23.76 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.41 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  27.47 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  23.76 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  22.4 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>