More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0261 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  100 
 
 
217 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.26 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  44.55 
 
 
223 aa  181  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  41.4 
 
 
236 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  41.4 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  41.4 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  35.55 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  32.71 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.31 
 
 
216 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  30.37 
 
 
212 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  30.84 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  31.28 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  30.84 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  30.84 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  31.28 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  31.63 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
266 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
272 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
272 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  28.37 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  29.44 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  28.97 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  27.88 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.97 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 
272 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  27.91 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 
221 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.17 
 
 
217 aa  94  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.48 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
272 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  26.89 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  30.52 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  29.25 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  26.89 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  28.3 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
226 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  28.37 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.03 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
272 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 
257 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
226 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  29.52 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  25.73 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  28.64 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  29.05 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
244 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  28.91 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.82 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  30.52 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  30.21 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.84 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.45 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  30 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  28.91 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.03 
 
 
219 aa  82  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.07 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.76 
 
 
234 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.7 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  29.19 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.2 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  25.85 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>