More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1368 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1368  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.668908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  97.57 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0492  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  96.6 
 
 
206 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0923435  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0774  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  66.49 
 
 
208 aa  264  7e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  45.05 
 
 
207 aa  156  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  40.11 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  38.46 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  37.13 
 
 
205 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.81 
 
 
212 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  30.98 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.29 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.13 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  29.83 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.2 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  28.73 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  31.32 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
266 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25.71 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 
272 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
272 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.81 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 
272 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  29.14 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  29.28 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  27.53 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  29.14 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  29.55 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  24.75 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.64 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  29.71 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  26.2 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  29.71 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  30.27 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1246  HAD superfamily hydrolase  28.7 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  27.81 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.86 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.91 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0907  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.76 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464753  normal  0.0304334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.49 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.47 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.36 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.17 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.76 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0569787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  28.41 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  25.79 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.57 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  25.81 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.79 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.6 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>