More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1367 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.75 
 
 
211 aa  134  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.68 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.14 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
234 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
225 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
227 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 
218 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.52 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 
235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
225 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  33 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
272 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  28.19 
 
 
233 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
272 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
272 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
227 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  27.46 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  32.69 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
227 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
227 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 
229 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 
225 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
272 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 
272 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 
242 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.2 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  25.74 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
272 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.79 
 
 
226 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
233 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.85 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 
250 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
216 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
228 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 
226 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
224 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 
227 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 
252 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
224 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
226 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 
257 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.55 
 
 
217 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 
252 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.26 
 
 
252 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
227 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.76 
 
 
227 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2787  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
230 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485008  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  34.26 
 
 
215 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
272 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
226 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  34.24 
 
 
216 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.01 
 
 
266 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 
231 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
235 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 
222 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  25.82 
 
 
225 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
230 aa  104  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
226 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
227 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 
221 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
227 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
234 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
231 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>