More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3289 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  66.51 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  64.93 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  66.34 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  62.75 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.43 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 468 aa  93.2  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.82 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.83 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.02 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.76 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.53 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3036  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  31.68 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.56 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  32.83 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.24 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2065  HAD-superfamily hydrolase  34.29 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  29.38 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.24 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.18 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.91 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  29.17 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.04 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.13 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  34.92 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 		 227 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  23.72 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  28.44 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.62 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.52 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.1 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.61 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.27 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.27 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  36.75 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.51 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  26.01 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.32 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.12 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  39.06 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  28.71 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  26.01 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.07 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>