More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4575 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.67 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  37.38 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  37.02 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  37.3 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  34.15 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  35.53 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.81 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  35.15 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  27.14 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  34.54 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.66 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  32.62 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.74 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  41.29 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  26.19 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.41 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  34.93 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.52 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  30.29 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  32.51 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.5 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2065  HAD-superfamily hydrolase  34.62 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.18 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.5 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0284  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.22 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.63 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  32.82 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  34.13 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  33.9 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  35.42 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.37 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  27.6 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  26.99 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  30.99 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  24.66 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  29.86 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 272 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  37.24 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.53 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  25.49 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  24.2 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>