More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0387 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  53.08 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  51.39 
 
 		 216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  54.17 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  53.55 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  51.4 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  50.47 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  50 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  49.25 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.76 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.5 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  34.47 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  34.17 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  34.69 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 		 252 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  35 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 225 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.15 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.77 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  33.84 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.2 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  32.51 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  25.74 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.82 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 		 272 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  26.24 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  34.69 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  34.04 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  31.84 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.53 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  29.02 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  31.58 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.98 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  30.16 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.77 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.77 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.84 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.16 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 		 252 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.77 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  30.96 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  30.96 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  32.97 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  28.08 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>