More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1899 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  57.21 
 
 
212 aa  222  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  50.93 
 
 
216 aa  218  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  50.24 
 
 
216 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  43.13 
 
 
217 aa  191  9e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  45.89 
 
 
212 aa  190  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  44.76 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.7 
 
 
213 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.23 
 
 
213 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  45.75 
 
 
213 aa  177  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.26 
 
 
225 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 
230 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
217 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
210 aa  99  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.51 
 
 
296 aa  97.1  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  34.18 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  33.15 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  33.15 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 
229 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  30.05 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  31.44 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.32 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  30.98 
 
 
216 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  36.07 
 
 
222 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  31.31 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  30.77 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
224 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 
216 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  30.77 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  30.77 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
227 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 
216 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.61 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  30.43 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  27.89 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
233 aa  84.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  33.68 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
217 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
241 aa  84.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  32.39 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.89 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.84 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.08 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  35.33 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.47 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.72 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  31.28 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.88 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  30.77 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.36 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.44 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.43 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  31.77 
 
 
221 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 
226 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
226 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  31.44 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
272 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  30.98 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>