More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3458 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.55 
 
 
228 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  49.32 
 
 
225 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  47.32 
 
 
228 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  49.32 
 
 
225 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  49.32 
 
 
225 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  48.17 
 
 
291 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.92 
 
 
232 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  42.08 
 
 
220 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  47.45 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  42.4 
 
 
232 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  38.36 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  38.24 
 
 
247 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.09 
 
 
222 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.15 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.15 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  35.43 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  39.81 
 
 
214 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  35.85 
 
 
221 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.37 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  36.41 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  36.41 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.02 
 
 
221 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  38.18 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 
221 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.03 
 
 
231 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  36.82 
 
 
216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.9 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.67 
 
 
223 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.08 
 
 
220 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.24 
 
 
217 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  35.32 
 
 
225 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.12 
 
 
229 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  37.13 
 
 
216 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  39.8 
 
 
216 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  40 
 
 
221 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  40 
 
 
221 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  39.59 
 
 
224 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  39.29 
 
 
224 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.24 
 
 
217 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.67 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  33.95 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  35.59 
 
 
227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  34.23 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.37 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  34.65 
 
 
217 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  34.65 
 
 
245 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.8 
 
 
216 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.04 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.51 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.94 
 
 
235 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  35.02 
 
 
219 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
219 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  32.26 
 
 
211 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.86 
 
 
244 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  31.5 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  28.63 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 
234 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.6 
 
 
220 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  29.9 
 
 
214 aa  95.5  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30.87 
 
 
223 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
233 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
223 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 
226 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
226 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.75 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.37 
 
 
218 aa  88.6  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.23 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.67 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  28.06 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  32.58 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  34.47 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.53 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.18 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  29.78 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  28.57 
 
 
229 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  29.78 
 
 
223 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.91 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 
224 aa  82  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  25.79 
 
 
212 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  29.9 
 
 
216 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  30.54 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.08 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  31.08 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  24.89 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>