More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2080 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  68.83 
 
 
238 aa  315  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  40.76 
 
 
219 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  36.7 
 
 
221 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  37.11 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.93 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.87 
 
 
221 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.18 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  36.24 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  38.53 
 
 
220 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.41 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  35.57 
 
 
237 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.28 
 
 
229 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  35.42 
 
 
224 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  35.27 
 
 
216 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 
221 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36 
 
 
217 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  35.42 
 
 
216 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 
221 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.02 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  34.9 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.66 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.01 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  33.66 
 
 
221 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  33.66 
 
 
221 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.81 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  32.91 
 
 
239 aa  116  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  33.91 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.65 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
218 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  32.52 
 
 
217 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  35.75 
 
 
291 aa  111  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  32.52 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  37.61 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  33.8 
 
 
227 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.22 
 
 
244 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  35.98 
 
 
214 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  33.02 
 
 
220 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.37 
 
 
252 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  37.09 
 
 
232 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
228 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.39 
 
 
221 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36 
 
 
217 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.31 
 
 
223 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  34.13 
 
 
221 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 
228 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.63 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  29.3 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.43 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.62 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.92 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.33 
 
 
220 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  36.92 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.49 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  31.38 
 
 
216 aa  89  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.71 
 
 
236 aa  89  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.71 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  34.04 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  30.99 
 
 
216 aa  85.1  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
219 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  35.45 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  34.78 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  28.84 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  36.32 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  32 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.68 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.91 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  27.65 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>