More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2065 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2065  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.93 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  35.55 
 
 		 264 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  37.08 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  35.2 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  37.77 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  34.64 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3398  phosphoglycolate phosphatase, putative  26.51 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000172911 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.97 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.8 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  34.18 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.8 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  24.47 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  28.97 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.62 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.21 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  25.73 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  32.55 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.17 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.57 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.14 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  33.51 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.6 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.96 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  24.21 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.71 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.31 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.05 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.92 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.39 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.51 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  34.05 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.37 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.89 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  27.23 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.32 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  30.89 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 562 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  27.47 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2191  HAD family hydrolase  33.93 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0671825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  27.47 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.89 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  30.32 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  27.59 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.88 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0649  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.63 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.82 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1198  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.07 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  32.53 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0907  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.98 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464753  normal  0.0304334 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.88 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>