More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4762 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  99.58 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  84.89 
 
 
230 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  41.4 
 
 
217 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  32.82 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.6 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  28.25 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 
216 aa  92  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  37.36 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.71 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.91 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  30.89 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  24.3 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.38 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  30.29 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  29.89 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  25.85 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.12 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.91 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.07 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.8 
 
 
257 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 
225 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.44 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  29.38 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.77 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  33.51 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.64 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.18 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  27.49 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.24 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  30.16 
 
 
216 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  32.65 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  35.36 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.99 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  28.04 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.65 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  32.61 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  28.37 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.81 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.05 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.81 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.81 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 
461 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  31.15 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.09 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.69 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  28.81 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  28.65 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  28.16 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.6 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>